4的通货膨胀率（零售物价指数）达到了21.7%，而1998年献出现了通货紧缩，为-2.6%（中国统计年鉴1999），这两年的会计数据尤其是一些增长指标会存在很大差异，所以说通货膨胀会导致数据不可比，虽然我们可以应用物价指数对通货膨胀情况进行调整，但如果1994年时没有通货膨胀，那么企业的投资决策和经营活动将是另一种情景了，这是无法调整的；其次，我国的会计准则和会计制度正在建设的过程中，每年都会有新的准则和制度出台，1997年
，1997年是关联方关系及其交易的披露准则、1998年是现金流量表和资产负债表日后事项准则、1999年是投资等准则和四项准备计提政策等，这些准则和制度都会导致各年度之间的会计数据缺乏可比性；最后，我国上市公司存在操纵会计数据和关联交易比重较大等现象，这些行为都是不可持续的，也会导致数据不可比。数据不可比会对样本的选取产生很大影响。
2.样本问题。在实证会计研究中使用一年的数据只能得到一个特殊的结论，不具有普遍意义，为了使研究结论适用于一般的，情况，在选取样本时我们一般要选择多年度、多行业的样本，但由于数据在不同年度之间又是不可比的，这会对统计检验的结果造成一定影响，此时我们就面临着一个两难选择：一个不“十分可信”的一般结论和一个“十分可信”的特殊结论。这种情况下我们要根据研究的具体问题和研究目的来选取样本，不同年度的数据可以放在一起进行研究，但使用时我们要特别小心。另一个问题是选择偏见，使用样本来推断总休的前提就是样本与总体具有相同的概率分布，或者说样本是随机选取的，但这一点很难做到，在很多研究中都存在选择偏见问题，在美国也是如此，这就便研究结论的有用性受到质疑。
3.理论基础。实证会计研究中提出假设和解释结论最好能够依据一定的理论来进行，在我们使用线性模型进行假设检验时，一个坚实的理论基础应该能够说明变量之间存在着线性关系，只能说明相关性而不能说明线性关系的理论也可以作为理论基础，但不够坚实，另一些实证会计研究还可能没有理论基础。在中国尤其是面对中国特有的问题时，找一个适合于中国现状的理论基础是很困难的，所以，目前我国的实证会计研究除了直接引用国外的模
